蛋白偶联常用于抗体制备，一般多肽为半抗原，体内容易酶解，偶联大分子蛋白以后便会成为完全抗原，经常用的三种载体蛋白，分别是BSA、KLH、 OVA。由于这些蛋白分子量比较大，只要偶联上以后就没法像线性短肽那样用HPLC纯化和质谱MS鉴定了，不过可以通过透析的方法去掉其中的小 分子达到进一步提纯的目的，并且提供偶联蛋白之前的线性肽质谱鉴定报告。